中華民國大氣層保護協會（AAPT, Association of Atmosphere Protection in Taiwan）於民國81年9月向內政部申請設立，同年11奉內政部核准正式成立為「中華民國臭氧層保護協會」。民國86年7月再申請及奉內政部核准更名為「中華民國大氣層保護協會」。
本協會之任務為推動全球性大氣層保護工作，促進全人類之福祉，並以從事協助有關大氣層保護之政策及法規之制定，或修訂、推動大氣層保護相關之管制及學術研究、技術研發、輔導及服務為宗旨。有關大氣層保護之範圍包括臭氧層之保護、溫室效應之防制及空氣品質之改善等項目。